Het aantal mensen dat de rekenkracht van hun pc doneert om nieuwe medicamenteuze therapieën tegen het coronavirus te helpen ontwikkelen, is enorm gestegen.
Crowdsourcing-project [email protected] is gespecialiseerd in het zoeken naar zwakke plekken in ziekten door ze te simuleren met behulp van de beschikbare computerbronnen van het publiek.
Het project had oorspronkelijk ongeveer 30.000 actieve gebruikers voordat de pandemie van het coronavirus begon.
Maar in de afgelopen twee weken is het aantal gestegen naar meer dan 400.000 gebruikers.
De toename van 1.200 procent in vrijwilligers werd genoemd in een Reddit Ask Me Anything die de projectleiders donderdag hielden.
Eind februari [email protected] kondigde aan dat het de coronavirusstam COVID-19 zou gaan bestuderen in de hoop een nauwkeurig model van de ziekte en zijn kwetsbaarheden te creëren.
Sindsdien hebben bedrijven, waaronder Nvidia, consumenten opgeroepen om de ongebruikte computerbronnen van hun pc aan het goede doel te schenken.
Download en installeer hiervoor het [email protected] app.
Om bij te dragen aan het coronavirusonderzoek, klikt u op “elke ziekte” bij het selecteren van welke ziekte u wilt helpen bestrijden.
De meer dan 400.000 vrijwilligers betekent het [email protected] project heeft toegang tot 474 petaflops aan rekenkracht.
Dat is meer dan twee keer de kracht van 's werelds snelste supercomputer, Summit, die ook is ingezet om onderzoekers te helpen bij het bestuderen van COVID-19.
Maar hoe helpt het simuleren van een virus eigenlijk? [email protected] hoopt te begrijpen hoe de virale eiwitten van de ziekte zich gedragen en zich binden aan de longcel van een slachtoffer.
Deze eiwitten vouwen constant in verschillende microscopisch kleine structuren.
Als gevolg hiervan is het maken van statische foto's van het coronavirus in actie niet voldoende om de ziekte volledig te ontleden.
"Eiwitten bewegen echt, en veel van de informatie daarover die niet in statische afbeeldingen staat, moet worden verzameld via simulaties", zei Rafal Wiewiora, een onderzoeker bij het project, tijdens de Reddit AMA.
Specifiek richt het project zich op het vinden van gaten of holtes in de virale eiwitten van COVID-19 die artsen kunnen “persen in een medicijnmolecuul” om de ziekte te neutraliseren, zei Wiewiora.
De simulaties zullen ook berekenen hoe sterk een bepaald medicijnmolecuul bindt aan een viraal eiwit.
Alle resultaten zullen worden gedeeld met de medische gemeenschap en farmaceutische bedrijven om hen te helpen een medicijn voor de markt te verfijnen.
Aanbevolen door onze redacteuren
Dankzij de toename van het aantal vrijwilligers, [email protected] heeft een ongekend aantal eiwitsimulaties kunnen uitvoeren, en in een sneller tempo.
“Persoonlijk is de doorloopsnelheid van het opzetten van een project tot het verkrijgen van bruikbare hypothesen uit de gegevens en het nemen van beslissingen over wat te doen enorm verbeterd - ik kan nu een proteïne runnen, kom binnen een week terug en weet al wat de volgende stap is.
dat wil zeggen, dit zou een maand tot een paar maanden duren, ”zei Wiewiora.
"We hebben al lange tijd records gebroken op het gebied van simulatiesnelheid en gegenereerde gegevens, maar wat er nu gebeurt, is een orde van grootte meer - echt een mijlpaal in gedistribueerd computergebruik," voegde hij eraan toe.
